行軍のルートを外れた移動部隊がフェストゥムに襲われた。<br>一騎と総士以外の真矢たちファフナー部隊が駆けつけるが、一騎は自分たちもザインとニヒトで出るべきだと主張する。<br>しかし、総士はその意見に反対し、この事態そのものに疑問を呈する。<br>一方、竜宮島もアザゼル型率いるフェストゥムの襲撃を受けていた。<br>今回のアザゼル型の攻撃には、ある目的があるようだった。<br>この緊急事態に、アルヴィス司令部は開発途中の新システムを導入する……！<br>脚本：冲方 丁　コンテ：鈴木 利正　演出：鈴木 利正　キャラクター作画監督：白井 瑶子／長屋侑利子／岡田万衣子　メカニック作画監督：大浪 太／松村 拓哉<br><br>動画一覧は<a href="http://ch.nicovideo.jp/channel/fafner-exodus">こちら</a><br>第12話 <a href="https://www.nicovideo.jp/watch/1427423238" class="watch">watch/1427423238</a><br>第14話 <a href="https://www.nicovideo.jp/watch/1444123650" class="watch">watch/1444123650</a>